Kokcydia to jednokomórkowe pasożyty psów i kotów oraz innych zwierząt wywołujące kokcydiozę. Objawy chorobowe występują najczęściej u zwierząt młodych, chorych, starych lub z obniżoną odpornością. Najczęstszym objawem kokcydiozy u psów i kotów jest biegunka, której nasilenie zależy od stopnia zarażenia. W przypadku intensywnej inwazji w kale może pojawić się śluz i krew. Inne objawy towarzyszące zarażeniu kokcydiami to wymioty, brak apetytu i odwodnienie. U zwierząt dorosłych zarażenie przebiega najczęściej bezobjawowo. Kokcydia wykrywane u psów i kotów należą do rodzajów: Cystoisospora, Cryptosporidium, Hammondia, Neospora, Toxoplasma i Sarcocystis. Do zarażenia dochodzi najczęściej na drodze fekalno-oralnej poprzez spożycie cysty/oocyty po sporulacji (Cystoisospora, Cryptosporidium). Innym źródłem zarażenia może być spożycie zarażonego mięsa lub gryzonia (Toxoplasma, Neospora, Hammondia, Sarcocystis).

Kokcydia dosyć powszechnie występujące u królików należą do rodzaju Eimeria spp. Pasożyty w zależności od gatunku zasiedlają komórki jelita cienkiego lub/i grubego, a także komórki nabłonka przewodów żółciowych wątroby. Choroba może objawiać się brakiem apetytu, bólami brzucha, wodnistą biegunką z widocznym śluzem i krwią, bladością błon śluzowych, anemią i apatią. U zwierząt dorosłych zarażenia przebiegają bezobjawowo.

Diagnostyka kokcydiów polega na badaniu parazytologicznym kału w kierunku obecności cyst/oocyst pasożytów. Badanie najlepiej wykonać z trzech prób kału pobranych w trzech kolejnych dniach.